重度乳頭內陷矯正術雖然在臨床應用較多，但它可能會出現一些副作用，求美者一定選擇正規醫療機構進行該手術，比較常見的副作用有：
① 乳頭紅腫、滲血：術后手術部位可能出現滲血、血腫的現象，嚴重者要盡快去醫院做相關處理。
② 乳腺管損傷：手術中如誤傷乳腺管，會影響受術者愈后正常哺乳。
③ 乳頭壞死：若縫合過程中過度縫扎皮瓣或術中術后發生感染，都會影響乳頭部位正常血運，造成乳頭壞死。
④ 瘢痕：愈合后乳頭乳暈部位會形成手術瘢痕。
⑤ 感覺障礙：術后乳頭可出現輕度感覺障礙，多在6個月后恢復正常。
⑥ 乳頭內陷復發：若手術時未將攣縮組織分離徹底或切斷，仍有纖維帶向下牽扯時可能會導致乳頭再次收縮內陷。