雖然電動負壓吸脂的方法所造成的切口較小，但是在少數情況下可能會有以下情況的發生：
1. 手術難度較大，有假性頰脂肪墊疝出的可能。
2. 男性病人胡須生長區域脂肪抽吸后容易損傷毛囊。
3. 血腫、血清腫：抽脂術后一種較為常見的并發癥，常在術后一周左右出現，一旦發生應及時就醫處理。
4. 感染：脂肪抽吸術有發生感染的可能，一旦發生應及時就醫換藥。
5. 皮膚麻木或疼痛，皮下硬結及因血管網破壞而引發的色素沉著等。
6. 皮膚缺血、壞死：脂肪抽吸術有發生皮膚缺血、壞死的可能，一旦發生，要盡量保護周圍皮膚，并盡快就醫。
7. 周圍神經損傷：抽吸的深度導致的神經損傷一般是暫時性的，可以逐漸恢復。
8. 局部凹凸不平：與抽吸平面及抽吸量有關，一旦發生應待完全消腫后再次就醫治療。
9. 皮膚肌肉粘連：造成局部皮膚與表情肌的粘連可能與脂肪抽吸量有關，一旦發生應及時就醫治療。
10. 肺栓塞及脂肪栓塞綜合征是很嚴重的術后并發癥，但極少發生。