肉毒毒素由于是一種具有神經毒性的制劑，在用于去鼻根橫紋的過程中，也會有發生副作用的可能，具體有如下幾點：
1. 表情不自然、畏光、流淚。
2. 局部腫脹、瘀斑。
3. 注射部位麻木、頭痛、緊繃感、鄰近部位皺紋加深。
4. 上瞼下垂、眉型改變及眉下垂，通常在注射后7-10天出現，可遵醫囑應用含腎上腺素的滴眼劑，有助于因過敏、流血等因素造成的明顯的暫時性眼瞼下垂的預防。
上述反應為暫時性，不需特殊處理，一般2-4周可逐漸恢復。