肉毒毒素注射腋臭去除術法雖然方法簡便，技術也相對成熟，但它仍可能出現一些較嚴重的不良反應，求美者一定去正規醫療機構治療，肉毒毒素注射可能出現的副作用有：
1. 腋窩部位肌肉力量減弱，但一般為暫時性的。
2. 局部腫脹，瘀斑。
3. 腋窩注射部位麻木、緊繃感。
4. 術后注射部位可能存在一定程度的疼痛感，一般會逐漸減退。
5. 由于A型肉毒毒素注射量不足導致術后效果不佳。