處女膜修補術雖然手術過程簡單，但也可能發生一些不良反應，生物粘合法處女膜修補術可能出現的不良反應有：
① 感染：手術環境差，容易導致手術中的外源感染，所以應選擇有安全保障的權威醫院。術后遵醫囑服用常規抗生素預防感染。
② 處女膜再次裂開：術后避免大幅運動，否則容易導致處女膜再次裂開。遇此情況可在適當時期再次手術。